慢性自发性荨麻疹发病机制的生物信息学研究
目的:利用生物信息学技术筛选慢性自发性荨麻疹(CSU)的关键差异表达基因,为研究CSU的生物学机制与治疗靶点提供新的思路.方法:从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载GSE72541数据集,使用R语言limma包筛选CSU组与健康对照组间的差异表达基因,并通过cluster-Profiler R包、STRING在线软件、Cytoscape3.8.2软件的MCODE插件分别对差异表达基因的功能、通路富集与蛋白相互作用进行分析.结果:研究发现CSU组与健康对照组共有86个差异表达基因,其中上调基因64个,下调基因22个(|logFC|>1&P.Val<0.05),GO分析显示,差异表达基因主要富集在血小板活化、血液凝固、中性粒细胞脱颗粒等生物过程;KEGG分析显示,主要与造血细胞系、移植物抗宿主病、金黄色葡萄球菌等相关.此外,建立的PPI网络筛选出62个节点及15个关键基因(CXCL10,MMP9,SELP,MME,ITGA2B,ITGB3,CLU,GP6,C5AR1,C6orf25,GP1BB,VWF,CR1,GP9,PLAU).结论:ITGB3,ITGA2B,MMP9及CR1等基因可能与CSU的发病密切相关.
荨麻疹、发病机制、生物信息学、差异表达基因
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R730.2;R587.2;R363.2
内蒙古自治区自然科学基金重大项目2021ZD15
2022-04-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共6页
359-364
