基于生物信息学筛选研究衰老小鼠免疫B细胞的基因差异

摘要：

目的 通过生物信息技术分析GSE72224 基因芯片数据,比较衰老小鼠与青年小鼠B细胞基因差异,探索关键基因,为衰老机制研究及药物研发提供思路.方法 通过NCBI提供的GEO数据库下载GSE72224,利用生物信息方法筛选衰老与青年小鼠B细胞差异表达基因,然后对差异表达基因进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因组百科全书(KEGG)信号通路分析,并且构建蛋白质相互作用网络获得关键基因和关键模块.结果 共筛选出 87 个表达基因,包括其中66 个下调基因及 21 个上调基因.差异表达基因主要参与B细胞活化、内质网及内质网蛋白加工通路等.通过构建蛋白质相互作用网络从而筛选出H2A组蛋白家族成员(H2af)x、Zeste基因增强子人类同源物(Ezh)2、蛋白二硫化物异构酶(Pdi)A4、H2B组家族成员b(Hist2h2bb)、白细胞介素(IL)-10、Sel1l、Dnajb9、泛素样含PHD和环指域(Uhrf)1 这 8 个关键基因.并且筛选出两个重要模块,模块中的基因主要也与内质网蛋白加工通路等有关.结论 H2afx、Ezh2、Pdia4、Hist2h2bb、IL-10、Sel1l、Dnajb9、Uhrf1 此 8 个关键基因,主要参与B细胞发育、DNA甲基化和内质网的蛋白质调控等过程.但是有关基因的上下游作用点还需深入研究.

关键词：衰老、B细胞、生物信息学、差异表达基因

所属期刊栏目：43

分类号：R34(人体生物化学、分子生物学)

资助基金：国家自然科学基金;北京市自然科学基金;中国中医科学院自主选题项目

在线出版日期：2023-10-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：5033-5038