大鼠颅脑损伤后不同时间基因差异表达

摘要：

目的 用生物信息学方法筛选出大鼠颅脑损伤后不同时间、不同区域的差异表达基因及信号通路,为后期研究提供线索.方法 运用R软件Bioconductor的limma包对大鼠颅脑损伤GEO数据进行差异表达基因筛选,再通过cluster-Profiler包对差异表达基因作GO富集分析及KEGG通路分析.结果 大鼠颅脑损伤后24 h和4 h相比:损伤同侧皮质差异表达基因共79个,主要为免疫、炎症、膜电位调节等基因;损伤对侧皮质差异表达基因共60个,为蛋白四聚化及神经活性配体-受体相互作用等基因;而对所有样品进行时间分组,只有44个基因的表达水平发现显著变化,主要为血液循环、心脏收缩以及面神经结构组织等基因.3种分组筛选出共同的上调基因为Dck和Smad7,下调基因为Cebpb.结论 大鼠颅脑损伤后24 h和4h相比:大脑不同区域的差异表达基因不相同,损伤同侧皮质比对侧皮质变化大;差异表达基因主要为免疫、炎症及调控中枢神经系统功能相关基因.

关键词：颅脑损伤、差异表达基因、基因芯片、富集分析

所属期刊栏目：42

分类号：R34(人体生物化学、分子生物学)

资助基金：江苏大学临床医学科技发展基金;江苏大学临床医学科技发展基金

在线出版日期：2022-11-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：5359-5361