利用ceRNA网络研究2型糖尿病周围神经病变的相关基因

摘要：

目的 探索有关2型糖尿病周围神经病变(DPN)的ceRNA网络调控机制,研究其发病机制及相关治疗靶点.方法 从GEO数据库下载GSE95849数据集.将矩阵文件探针名重注释为基因名,添加基因属性以区分mRNA和lncRNA.运用R语言分析2型糖尿病不伴周围神经病变患者与2型DPN患者外周血的差异lncRNA与差异mRNA.预测差异lncRNA相关的miRNA及mRNA,与差异mRNA取交集,从而得到lncRNA-miRNA-mRNA网络,分析ceRNA网络中mRNA的功能与相关通路,使用STRING数据库分析蛋白互作关系,筛选关键蛋白互作模块.结果 2型DPN与不伴周围神经病变中差异ln-cRNA与mRNA竞争miRNA,从而调控蛋白合成,最终影响丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、转化生长因子(TGF)-β信号传导途径等,发现了5种途径可能是DPN的发病机制:通过上调肌醇-四磷酸(ITPK)1-激酶反义RNA(AS)1以下调hsa-miR-17-5最终上调热休克蛋白(HSP)A8;通过上调C20orf197以下调hsa-miR-20b-5p最终上调HSPA8;通过上调C20orf197以下调hsa-miR-129-5p,最终上调残疾基因同源物(DAB)2;通过上调MIR600HG以下调hsa-miR-129-5p,最终上调DAB2;通过上调ITPK1-AS1以下调hsa-miR-129-5p,最终上调DAB2.HSPA8、DAB2在DPN中起到重要作用,而C20orf197、ITPK1-AS1两种lncRNA在DPN发生中同时调控HSPA8及DAB2蛋白,起到关键作用.结论 发现了5种lncRNA-miRNA-mRNA调节机制与2型DPN有关.

关键词：2型糖尿病周围神经病变(DPN)、ceRNA、lncRNA、miRNA、生物信息学

所属期刊栏目：42

分类号：R587.1(内分泌腺疾病及代谢病)

资助基金：福建省自然科学基金项目2016J01496

在线出版日期：2022-06-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：2345-2351