10.3969/j.issn.1005-9202.2021.07.002
冠状动脉粥样硬化性心脏病患者外泌体lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA网络分析
目的 基于长非编码(lnc)RNAs和环状(circ)RNAs的竞争性内源(ce)RNA调控假说,探讨冠状动脉粥样硬经性心脏病(CHD)的潜在分子机制.方法 从exoRBase数据库下载正常人和CHD患者血液外泌体样本数据,使用R语言软件对其进行差异表达分析.利用TargetScan、miRanda、miRcode和ENCORI网站及cytoscape3.7.2软件构建差异lncRNA/cir-cRNA-miRNA-mRNA相互作用网络.使用DAVID数据库对获得的差异表达mRNA进行GO和KEGG富集分析.结果 通过比较两组mRNA、lncRNA、circRNA表达水平,共找出312个差异mRNA、43个差异lncRNA和85个差异circRNA.关键差异表达涉及hsa_circ_0000038、hsa_circ_0000160、hsa-miR-27a-3p、hsa-miR-23b-3p、hsa-miR-363-3p等.GO功能富集分析得到GO条目69个(P<0.05),KEGG通路富集筛选得到4条通路与CHD相关(P<0.05),涉及胰高血糖素、雌激素信号通路等.结论 通过基因芯片分析和数据库挖掘等方法构建的调控网络,为CHD的早期临床诊断标志物提供了可靠的研究方向,同时也为中医药干预治疗CHD提供了新的思路.
冠状动脉粥样硬化性心脏病、外泌体、差异表达、竞争性内源RNA、调控网络
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R541.4(心脏、血管(循环系)疾病)
国家自然科学基金项目81660781,81960849
2021-04-12(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共8页
1349-1356