10.3969/j.issn.1005-9202.2020.22.040
神经源性高血压小鼠差异靶基因分析——基于GEO数据库数据挖掘
目的 通过分析GSE25076基因芯片数据,探索神经源性高血压小鼠下丘脑的差异基因,尝试寻找该病的潜在治疗靶点.方法 在NCBI提供的GEO2R平台内检索GSE25076,将全部数据下载保存为Excel格式,并进行差异基因分析.采用DAVID平台进行GO分析,京都基因与基因组百科全书(KEGG)平台进行KEGG通路分析,STRING平台进行基因互作(PPI)分析.结果 在GEO2R平台内对神经源性高血压小鼠芯片数据进行分析,共获得34760个差异基因,最终获得28个符合条件的基因.这28个差异基因富集在磷脂分解代谢过程、水解酶活性调节等过程.KEGG分析表明其富集于RNA转运通路.结论 真核翻译起始因子(EIF)4A3和核糖核酸酶(POP4)最为可能是神经源性高血压发生的基因层面的原因,通过RNA转运通路,影响神经发育、血管生成及神经发生等过程,最终导致本病的发生发展.
神经源性高血压、生物信息学、差异基因、GEO数据库、基因芯片
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R34(人体生物化学、分子生物学)
国家重点基础研究发展计划973计划课题;广东省高水平大学建设项目2017年
2020-12-03(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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