基于多组学高通量数据分析乳腺癌中8号染色体开放阅读框33的表达和预后

摘要：

目的 揭示乳腺癌组织中8号染色体开放阅读框(C8orf)33基因的表达及预后意义.方法 利用cBioPortal门户网站分析C8orf33基因突变、拷贝数变化、mRNA水平变化、mRNA差异表达与预后关系,基因拷贝数畸变通过Oncomine分析乳腺癌组织与正常组织中C8orf33表达差异;利用多组学数据分析门户网站LinkedOmics分析浸润性乳腺癌组织中C8orf33基因表达与临床指标相关性及基因拷贝数畸变、甲基化水平与C8orf33表达的相关性.结果 cBioPortal分析结果显示,38％ (417/1093)乳腺癌患者发生了C8orf33基因改变,包括基因扩增、缺失、错义突变和mRNA水平改变,其中C8orf33mRNA水平上调占比34％,且C8orf33高表达不利于患者预后(P＜0.01).Oncomine结果显示乳腺癌组织中C8orf33表达显著高于正常乳腺组织(P＜0.01);LinkedOmics结果显示浸润性乳腺癌患者中C8orf33表达水平分别受PAM50分子分型、组织学分型、肿瘤纯度和种族影响(均P＜0.01);C8orf33 mRNA水平与其基因拷贝数畸变呈正相关(r=0.800,P＜0.001),与其DNA甲基化水平呈负相关(r=-0.109,P＜0.01).结论 乳腺癌中C8orf33基因拷贝数增加和低甲基化促进其高表达,C8orf33高表达不利于乳腺癌预后,可作为乳腺癌预后的候选标志物.

关键词：乳腺癌、8号染色体开放阅读框33、预后、拷贝数变化、甲基化

所属期刊栏目：39

分类号：R737.9(肿瘤学)

资助基金：江苏省卫生计生委科研项目Y2018101;江苏省高等学校自然科学面上项目18KJB310002;江苏省“青蓝工程”项目2016;江苏医药职业学院科技创新团队建设计划20188104

在线出版日期：2019-08-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：2628-2630