10.3969/j.issn.1005-9202.2019.05.051
miR-139-5p在多形性胶质母细胞瘤中的表达与靶基因验证
目的 探索miR-139-5p在多形性胶质母细胞瘤(GBM)患者中的表达水平,预测和验证miR-139-5p的靶基因.方法 利用实时定量PCR检测GBM患者和对照组脑组织中miR-139-5p的相对表达水平.选择starBase在线工具预测miR-139-5p的靶基因,通过TargetScan数据库分析miR-139-5p与靶基因的结合位点,并采用萤光素酶报告实验验证.检索miRPathDB数据库分析miR-139-5p靶基因显著富集的pathways,运用miRTargetLink工具构建miR-139-5p与其靶基因之间的交互网络.结果 相对于对照组,miR-139-5p在GBM患者脑组织中的表达水平显著下调.starBase预测工具取交集后得到8个靶基因,其中真核翻译起始因子4γ2(EIF4G2)为miR-139-5p靶基因之一.萤光素酶报告实验表明EIF4G2基因3′UTR区中含有明确的miR-139-5p结合位点.pathway富集分析发现靶基因显著富集于胰岛素样生长因子(IGF)-1信号通路、神经营养因子通路、趋化因子通路、T细胞受体通路、Ras信号通路和转化生长因子(TGF)-β信号通路等.结论 miR-139-5p在GBM患者中低表达,可能通过抑制靶基因EIF4G2表达参与肿瘤发生相关的过程.
多形性胶质母细胞瘤、miR-139-5p、靶基因、生物信息学
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R739.41;R394.3(肿瘤学)
2019-04-04(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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