10.3969/j.issn.1005-9202.2015.14.013
两株抗肝癌细胞单链抗体三维结构的同源模建
目的:模建特异性抗肝癌单链抗体HscFv 41-6和scFv DM的三维结构,比较两者结构的异同,为高亲和力的抗肝癌单链抗体的人源化设计提供结构信息。方法采用同源模建技术,在SGI图形工作站上,通过Accelrys公司InsightⅡ软件包的Homology模建分子结构,用Discover进行分子力学和动力学优化,最后用Prostat验证模拟结构的合理性。结果 HscFv 4-16和scFv DM六个CDR 襻位于Fv段的N端,形成一个与抗原结合的口袋,口袋分别深15.6á和16.1á。其中CDRL3和CDRH3与抗原最接近,有较多接触。 scFv DM的CDRL3和CDRH3两个襻比scFv 4-16的更靠近中央。结论采用同源模建技术成功模建特异性抗肝癌单链抗体HscFv 4-16和scFv DM的三维结构,scFv DM的三维结构显示与抗原的结合更紧密,亲和力比 HscFv 4-16高,与实验检测结果一致。
肝肿瘤、抗体结构、同源模建
R363(病理学)
广东省科技计划项目基金2006B19901014
2015-08-20(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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