10.3969/j.issn.1005-9202.2015.09.018
Kruppel样因子4在胃癌细胞中的表达及KLF4基因启动子区的生物信息学分析
目的:检测Kruppel样因子KLF4基因在人胃癌细胞株MKN-45及人正常胃黏膜上皮细胞株GES-1的表达情况,并应用生物信息学方法分析KLF4基因启动子区序列,预测胃癌发生中其涉及的转录调控因子。方法采用实时荧光定量 PCR 方法检测 MKN-45及 GES-1中 KLF4 mRNA的表达;利用多种在线软件获取并分析人KLF4基因启动子序列,预测其转录因子结合位点和胃癌组织中相关的转录因子。结果实时定量PCR检测结果显示:KLF4 mRNA在人胃癌细胞株MKN-45中的表达低于在人正常胃黏膜细胞株 GES-1中的表达(4.24±0.15 vs 6.66±0.23)( P<0.01);KLF4基因启动子序列全长为4915 bp,共涉及183个转录因子结合位点,在胃癌中异常表达的转录因子有17个,包括AP-1、AP-2、HIF-1、SP3等。结论 KLF4 mRNA在胃癌细胞株MKN-45中表达下调,生物信息学分析提示在胃癌发生中 AP-1、AP-2、HIF-1、SP3转录因子等可能参与调控KLF4的表达。
Kruppel样因子4、胃肿瘤、启动子、生物信息学
R73(肿瘤学)
贵州省科学技术基金项目〔2012〕2240
2015-05-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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