星形细胞瘤的基因表达谱和Hierarchical聚类研究

摘要：

目的探讨人脑星形细胞瘤发生发展中相关基因及分类特征基因的表达.方法用含13939种人基因的BioStarH140S芯片,以正常脑及18例胶质瘤组织总RNA制备的探针杂交芯片,ScanArray 4000扫描信号,提取脑及不同级别星形细胞瘤的差异基因并行生物信息分析,Hierarchical聚类提取差异基因的特征.结果星形细胞瘤中筛选出438条(3.14%)差异表达基因;信息分析与细胞信号、细胞骨架和运动、癌基因及抑癌基因等多类基因密切相关;与分类相关的特征基因有MAP7、DBCCR1、PCDHA5、KCNABl、NAP1L2等.表达谱将星形细胞瘤分成两类,与临床组织病理分类基本一致.结论芯片是基因分析和筛选肿瘤标志性基因的有效手段,可客观分析星形细胞瘤发展及预后;分类特征基因为星形细胞瘤侵袭性和预后判断提供依据,有助于临床诊治.

关键词：星形细胞瘤、基因芯片、表达谱、Hierarchical 聚类

所属期刊栏目：9

分类号：R739.41;Q786(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金;上海市科委项目

在线出版日期：2004-08-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：97-101