人类基因组DNA甲基化数据分析的研究现状

摘要：

作为人类基因组最为典型的表观遗传现象,DNA甲基化在多种关键生理活动中扮演重要角色.系统分析基因组尺度的DNA甲基化概况意义重大.从CpG岛等基本定义出发,阐述了高通量DNA甲基化的检测技术以及针对芯片技术与下一代测序技术的低水平数据处理方法;重点对比了基于机器学习理论对CpG位点及CpG岛甲基化水平的预测算法,以及所利用的特征对预测效果的影响与发展趋势;并对DNA差异甲基化在组织特异性、癌症等多种疾病中的计算分析进行了全面的综述.

关键词：DNA甲基化、检测技术、预测方法、差异甲基化、CpG岛

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资助基金：国家自然科学基金批准号:61105003和中央高校基础研究基金批准号:A03007023801210资助项目

在线出版日期：2015-07-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：450-459