一小时蛋白质组:基于Q-OT-qIT质谱系统的蛋白质组学快速鉴定

摘要：

随着“一小时酵母蛋白质组”的实现,短梯度下实现蛋白质组深度覆盖成为可能.利用全新Q-OT-qIT三合一质谱系统进行“一小时蛋白质组”分析与优化.50 min有效梯度,单次实验分别从1 μg和50 ng HeLa全蛋白中鉴定到20860和14100条肽段,对应到3865和2877个非冗余蛋白,而目前的文献报道至少需要2～3 h.同时,考察了Q-OT-qIT碎裂模式、检测方法、最大注入时间和自动增益控制等参数对蛋白质组快速分析的影响,证明了不同采集方法间的互补性,阐述了不同扫描参数对鉴定结果的影响.此外,还讨论了Q-OT-qIT的并列运行原理和扫描组合模式,为不同实验目的和样本类型的蛋白质组快速分析奠定了基础.

关键词：蛋白质组学、快速鉴定、深度覆盖、静电场轨道阱、Q-OT-qIT质谱

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在线出版日期：2014-06-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：528-536