线粒体全基因组测序探寻高原环境对Artemia tibetiana和A.urmiana卤虫种线粒体基因的影响

摘要：

卤虫(Artemia)属甲壳纲无背甲目,生活于高盐环境中,低海拔和高海拔地区均有分布,在适应不同环境需求的过程中形成了遗传的多样性.为研究卤虫表型的可塑性,本研究对2个来自青藏高原的A tibetiana和1个来自伊朗乌尔米耶湖的Aurmiana的线粒体进行了全基因组测序,将获得的3个序列信息与另一低海拔平原上的卤虫种A.franciscana进行比较分析.在线粒体蛋白编码基因的序列比对中发现:A.franciscana和A.tibetiana/A.urmiana组间atp8基因的Ka/Ks值最高,而A tibetiana和Aurmiana组间,atp6基因的Ka/Ks值最高.鉴于A.tibetiana和Aurmiana遗传距离较近,但分别分布于高海拔和低海拔,环境差异显著,提示在高原环境适应过程中atp6基因可能受到强的选择压力.在D-loop区鉴别到2个延长终止相关的序列(ETASs)和3个保守序列块(CSBs),猜测D-loop或者呼吸链亚基的序列变化,可单独或共作用促进卤虫适应不同海拔环境.

关键词：线粒体基因组、Artemia tibetiana、序列变化、高原物种

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资助基金：国家自然科学基金30221004;国家重点基础研究发展计划2011CB944100

在线出版日期：2014-03-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：319-331