糜子miRNAs的生物信息学预测及实验验证

摘要：

microRNA是一类在转录后调控中发挥重要作用的非编码小RNA,其靶标参与高等植物的发育、代谢、胁迫应答等生物学过程.糜子是一类重要的禾谷类作物,但目前还未见与其相关的miRNA报道.通过基于表达序列标签和miRNA前体二级结构的同源搜索,鉴定到43个新的miRNAs.这些miRNAs不均匀地分布于11个miRNA家族.利用psRNAtarget对这些miRNAs分析表明,它们调控68个靶标基因.11个miRNAs家族中的10个参与了RNA调控,表明了它们在糜子转录后调控中的基本作用.利用Northern blot对8个家族的miRNAs进行了鉴定,表明本实验的预测方法是有效的.

关键词：microRNA、糜子、预测、验证、靶标

所属期刊栏目：42

分类号：Q1-0

资助基金：国家自然科学基金30600384;50809068

在线出版日期：2012-12-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：757-767