猪囊胚microRNA定量PCR分析中适宜内参基因的选择

摘要：

在定量PCR中,通常使用表达量恒定的基因作为内参对实验结果进行校正,以得到准确的定量结果.本实验用低密度芯片方法对猪体细胞核移植(SCNT)、体外受精(IVF)、体内受精(IVO)及孤雌(PA)囊胚的microRNA表达情况进行了定量分析,结果发现,4种类型胚胎共同表达的microRNA数目为36种,其中11种microRNA的表达量不受胚胎种类的影响(P＞0.05).以这11种microRNA为候选内参基因用GeNorm(一种以两两比较为模型,计算样品中所有候选内参基因稳定值的程序,可得到样品中表达最为稳定的一对内参基因组合)及NormFinder(excel加载宏,以方差分析为模型对候选内参基因的稳定性进行分析,可得到稳定性最高的候选内参基因)方法分析发现miR-16表达最为稳定,以miR-16为内参得到的相对定量结果与用细胞数校正的定量结果一致,证实了miR-16是猪囊胚microRNA定量PCR分析的适宜内参基因.

关键词：内参基因、定量PCR、microRNA、囊胚

所属期刊栏目：42

分类号：S828(家畜)

资助基金：国家重点基础研究发展计划2006CB102106;2007CB947402;国家自然科学创新基金30621064

在线出版日期：2012-07-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：203-208