从真菌全基因组中筛选丛赤壳科的DNA条形码
将粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)的注释基因分别与30种丝状子囊菌基因组比较,根据E值大小预测同源序列,从中选择Hsp90,AAC,CDC48和EF3作为候选基因,以丛赤壳科(Nectriaceae) 13个属34个概念清晰的种为材料,对215个序列片段采用不同方法进行分析,筛选适合于该科的DNA条形码.将种内与种间序列差异以及序列获得的难易程度作为评价指标.结果表明,Hsp90和AAC基因虽然具有较高的PCR扩增与测序成功率,但种内,种间距离频率分布存在重叠,可能导致部分种的鉴定错误；CDC48基因可以恰当地区分种内与种间差异,但扩增与测序成功率相对较低；EF3基因不存在种内、种间遗传距离重叠,序列容易获得,适合作为该科真菌的DNA条形码.
E值、同源基因序列、PCR扩增与测序成功率、序列分析
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Q75(分子遗传学)
2012-06-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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