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新丛赤壳属真菌DNA条形码研究

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以新丛赤壳属19个种为材料,选择ITS rDNA,β-tubulin,EF-lα和RPB2作为候选基因,对获得的205个序列片段采用不同方法进行分析,筛选该属的DNA条形码.将种内与种间序列差异以及序列获得的难易程度作为评价指标.结果表明,任何一个单独的基因都不宜作为其DNA条形码,EF-1α与RPB2基因组合可以准确识别种内与种间差异,建议作为该类真菌的DNA条形码.研究过程中,将形态学与序列分析相结合,发现顶环新丛赤壳和小孢新从赤壳两个隐存种.

种内与种间序列差异、PCR与测序成功率、序列分析、形态学、顶环新丛赤壳、小孢新从赤壳

41

Q939.5(微生物学)

国家自然科学基金31070015和31000009;中国科学院知识创新工程项目KSCX2-EW-J-6;中国科学院应用微生物研究网络项目KSCX2-YW-G-068

2012-01-16(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

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1006-9259

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41

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