猪CACNAlS基因部分序列的克隆、测序及SNP检测
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10.3321/j.issn:1006-9259.2008.01.008

猪CACNAlS基因部分序列的克隆、测序及SNP检测

引用
CACNAlS是钙离子通道主效亚基α1亚单位的编码基因,该基因突变会导致人(Homo sapiens)低钾性周期性麻痹和恶性高温综合征.目前CACNAIS基因的研究主要集中在人和模式动物上,而在家畜中的研究少见报道.本研究以金华猪(115头)、皮特兰猪(30头)、金华猪与皮特兰猪杂交产生的金皮F2代杂种猪(126头)、大约克猪(23头)为研究对象,根据人CACNAIS基因序列设计引物,对猪基因组DNA进行PCR扩增、克隆测序,并与人相应序列作同源性比较,然后采用PCR-SSCP技术检测序列中可能存在的单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,并对有合适内切酶存在的突变点应用PCR-RFLP技术进行验证.结果表明:(I)用6对引物对猪基因组DNA进行扩增,共克隆得到猪CACNAIS基因约5211 bp的DNA序列,其中外显子区域,猪与人同源性为82.6%,序列已递交GeneBank收录(登录号DQ767693);(ii)在克隆得到的DNA序列中,共检测到57个单核苷酸突变点,其中外显子区域存在24个;(iii)突变位点的PCR-RFLP验证与PCR.SSCP检测结果一致,经与GenBank公布的猪CACNAIS基因EST小片段(Bx914582,Bx666997)比较,相应长度核酸序列内本实验检测到的11个SNP位点中,有8个位点的碱基突变与2个EST片段间存在的碱基差异相同.

猪(Sus Scrofa)、CACNAIS、单核苷酸多态(SNP)、PCR-SSCP、PCR-RFLP

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S8(畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂)

国家自然科学基金30371024;国家重点基础研究发展规划973计划2006CB102101

2009-04-24(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共8页

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1006-9259

11-3755/N

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2008,38(1)

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