大麦黄矮病毒GAV基因组全序列测定及其结构分析

摘要：

测定了在中国分离得到由麦二叉蚜和麦长管蚜传播的大麦黄矮病毒GAV的基因组核苷酸全序列, 该病毒分离物的RNA由5685个核苷酸组成, 内含6个开放阅读框架(ORF)和4个非编码区(UTR), 基因组大小和结构与黄症病毒属(Luteovirus)的大麦黄矮病毒PAV(BYDV-PAV)和MAV(BYDV-MAV)相似. 序列分析表明, 它与BYDV- MAV的PS1分离物基因组序列的同源性最高. 在6个开放阅读框架中, 除ORF6核苷酸序列同源性为72.0%外, 其他ORF的核苷酸序列同源性均大于90%. 两者全基因组的同源性为90.4%. 推导的编码产物氨基酸序列同源性除P6和通读蛋白(RTP)分别为67.4%和87.4%外, 其他均大于90%, 其中外壳蛋白(CP)为95.5%. 根据与BYDV-MAV的相似性, BYDV-GAV应是一种与BYDV-MAV类似的病毒.

关键词：大麦黄矮病毒GAV、基因组结构、分类学

所属期刊栏目：33

分类号：S432(病虫害及其防治)

资助基金：国家重点基础研究发展计划973计划TG2000016201;国家自然科学基金39970034

在线出版日期：2004-02-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：505-513