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10.19438/j.cjoms.2019.01.004

PLAG1转基因小鼠中差异表达长链非编码RNA的筛选分析

引用
目的:应用基因芯片技术,筛选PLAG1转基因小鼠下颌下区多形性腺瘤中差异表达的长链非编码RNA(LncRNA).方法:取3对PLAG1转基因小鼠下颌下区多形性腺瘤组织、对侧无瘤腺体组织、空白对照小鼠腺体组织,抽提标本总RNA并反转录合成cDNA探针,与芯片杂交后获得荧光信号,分析在肿瘤组织中差异表达的长链非编码RNA.随机挑选其中5个LncRNA,利用实时荧光定量PCR在6对样本中验证其表达.采用SPSS 13.0软件包中的t检验评价表达差异.结果:基因芯片结果显示,与PLAG1转基因小鼠无瘤腺体组织、空白对照小鼠腺体组织相比,PLAG1转基因小鼠肿瘤中共有5627个LncRNA同时发生差异表达,其中2871个上调、2756个下调.实时荧光定量PCR结果显示,5个随机挑选的LncRNA中,4个(AK146794、ENSMUST00000119440、ENSMUST00000140495、Gm12873)与基因芯片结果一致.结论:应用基因芯片筛选出PLAG1转基因小鼠中差异表达的长链非编码RNA,为进一步研究多形性腺瘤的发病机制提供了依据.

基因芯片、多形性腺瘤、PLAG1转基因小鼠、长链非编码RNA

17

R739.8(肿瘤学)

国家自然科学基金青年项目81302359;上海市科学技术委员会研究基金项目16ZR1418800

2019-03-20(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共6页

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1672-3244

11-4980/R

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