地黄甲基转移酶/去甲基化酶基因的注释及其在块根发育过程中的表达分析

摘要：

利用Windows-BLAST软件同源比较分析获得地黄转录组中的DNA甲基转移酶/去甲基化酶基因,同时利用基因表达谱测序方法分析这些基因在地黄不同发育时期块根中的转录子水平.利用拟南芥11个C5-M T ase和4个DM ase基因的蛋白序列进行同源性比对,在地黄转录组中共获得了18个DNA甲基转移酶unigene和11个去甲基化酶unigene.差异表达基因(DEG)分析显示,11个DNA甲基转移酶unigene和5个去甲基化酶unigene在块根的发育过程中表达具有差异,随块根发育成熟转录子表达含量逐渐降低,说明甲基化基因参与调控地黄块根的发育.首次挖掘和分析了地黄基因组中DNA甲基转移酶/去甲基化酶基因的分布和表达,为进一步研究DNA甲基化在地黄块根发育以及连作下块根生长受抑的表观遗传学分子机理奠定了基础.

关键词：中药资源、地黄、DNA甲基转移酶、DNA去甲基化酶、转录组、块根发育、数字基因表达谱

所属期刊栏目：12

分类号：Q786(基因工程（遗传工程）)

资助基金：高等学校博士学科点专项科研基金资助项目20131106120029;国家自然科学基金资助项目81403039,81373915

在线出版日期：2018-01-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：2135-2140