基因组规模代谢模型在细菌感染治疗领域的研究进展

摘要：

基因组规模代谢模型(genome-scale metabolic model,GSMM)是通过整合基因组学、转录组学、文献组学、蛋白质组学以及代谢组学等多组学数据,建立基因-蛋白质(酶)-生化反应关联组成的特定微生物代谢网络[1].GSMM将从基因组获得的生化反应信息与代谢表型进行桥接,为从系统上理解微生物生理代谢功能模型提供一个高效平台[2].GSMM最初主要应用于工业微生物制造领域,具体包括①分析代谢网络属性;②预测和分析微生物生长表型;③基于模型的组学数据阐释;④系统代谢工程[2].近几年,GSMM逐渐应用于细菌感染治疗领域,Oberhardt等[3-4]通过GSMM的建立,阐释了病原菌的感染过程和致病机制,提出该建模方法不仅可创新性用于新靶标抗菌药物的发现,还有助于更好地理解疾病的发病机制,优化治疗策略.本文就基因组规模代谢网络模型的构建及其在抗感染治疗领域的应用进行综述,以期为抗感染治疗及新药开发提供参考.

关键词：基因组规模代谢模型、细菌感染、抗菌作用机制、新靶标

所属期刊栏目：20

分类号：Q78;R51(基因工程（遗传工程）)

资助基金：科技部“重大新药创制”科技重大专项2017ZX09304005

在线出版日期：2020-09-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：452-456