目标基因测序技术检测后纵韧带骨化致病基因突变

摘要：

[目的]建立目标基因测序技术,对后纵韧带骨化(ossification of the posterior longitudinal ligament,OPLL)患者的11个已知致病基因进行突变筛查,探讨OPLL与致病基因突变的关系.[方法]提取6例OPLL患者外周血全基因组DNA,利用GenCap目标基因捕获技术(北京迈基诺公司),设计骨形态发生蛋白-2(bone morphogenetic protein 2,BMP2)、骨形态发生蛋白-4 (bone morphogenetic protein 4,BMP4)、骨形态发生蛋白-9(bone morphogenetic protein 9,BMP9)、Ⅺ型胶原蛋白α2 (collagen type Ⅺ alpha 2,COL11A2)、Ⅵ型胶原蛋白α1 (collagen type Ⅵ alpha 1,COL6A1)、核苷酸焦磷酸酶(ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 1,ENPP1)、成纤维细胞生长因子2(fibroblast growth factor 2,FGF2)、成纤维细胞生长因子受体1(fibroblast growth factor receptor 1,FGFR1)、成纤维细胞生长因子受体2(fibroblast growth factor receptor 2,FGFR2)、转化生长因子-β3(transforming growth factor beta 3,TGFB3)和转化生长因子-β受体2(transforming growth factor beta receptor Ⅱ,TGFBR2)基因外显子区域特异性捕获探针,与基因组DNA文库进行杂交,将目标基因组区域的DNA片段进行富集后,再利用illumina hiseq2000第二代测序仪进行测序,通过数据分析,确定突变位点,对选定的突变位点用Sanger测序法进行验证.[结果]设计合成的目标基因特异性捕获探针可有效地捕捉并富集基因组DNA的目标靶片段.目标区域平均测序深度为426.85 ～ 976.15,99.30％～100％目标区域覆盖度.在1例患者中发现COL6A1基因的1个错义突变,此位点检测结果与Sanger测序结果完全一致.[结论]目标基因测序技术成功发现了OPLL患者的致病基因突变.该方法快速而有效,对深入研究OPLL的分子病因学有重要意义.

关键词：后纵韧带骨化、致病基因、目标基因测序

所属期刊栏目：24

分类号：R318(医用一般科学)

资助基金：北京大学-清华大学生命科学联合中心交叉培育计划项目

在线出版日期：2016-03-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：270-273