病毒宏基因组学在献血人群病毒鉴定的应用研究

摘要：

目的 探讨宏基因组学技术在献血人群中病毒鉴定的应用潜力,并评估其在提高血液制品安全性方面的效能.方法 采用前瞻性队列研究设计,收集了 15名献血者的血液样本.通过QIAamp Viral RNA Mini Kit提取核酸,并使用 Phusion High-Fidelity PCR Master Mix 进行 PCR 扩增,随后使用 NEBNext UltraTM DNA Library Prep Kit构建测序文库.样本通过Illumina HiSeq平台进行双端测序,再进行数据质量控制和宏基因组分析.结果 在15名献血者样本中,平均总Reads数量为9.86× 106±6.11×105,平均总碱基数为1.55× 109±6.36×107.质量分数Q20和Q30的平均碱基数分别为1.52× 109±7.04 × 107和1.47 × 109±5.95 × 107,平均占比分别为98.81％±0.02％和95.60％±0.06％,GC 含量平均占比为 65.99％±0.16％.宏基因组分析鉴定出包括 Dinovirus,parvovirus,torque teno virus,papillomavirus,Merkel cell polyomavirus,herpesvirus_6A,herpesvirus_6B,human pegivirus,polyomavirus 在内的9类病毒.结论 宏基因组学技术能够在献血样本中检测到多种病毒,包括传统筛查可能遗漏的类型.该技术可作为提高献血安全性的有效工具,有助于发现和预防病毒传播,但也需要进一步研究以优化数据处理和解释.

关键词：献血者、病毒宏基因组学、高通量测序、病原体检测、血液安全

所属期刊栏目：19

分类号：S852.65;R373;R457.1

资助基金：沧州市科技局重点研发计划项目No.204106025

在线出版日期：2024-06-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：631-635,641