羊口疮病毒E3L蛋白亚细胞定位及生物信息学分析

摘要：

目的 克隆羊口疮病毒020基因,构建其重组真核表达质粒并转染HeLa细胞,分析020基因编码E3L蛋白的亚细胞定位,分析该蛋白生物信息学特征.方法 提取羊口疮病毒基因组,PCR扩增020基因并构建重组真核表达质粒,转染HeLa细胞,采用Western blot检测其在该细胞中的表达,免疫荧光法检测该蛋白的亚细胞定位.利用DNAstar软件分析不同毒株ORFV E3L氨基酸序列特点及其遗传演化关系;利用SOMPA软件分析其二级结构;利用SignalP4.0软件预测信号肽;利用TMHMM2.0软件预测跨膜结构;利用NetPhos 3.1预测磷酸化位点;利用NetNGlyc-1.0预测糖基化位点;应用IDEB和SYFPEITHI预测ORFV E3L蛋白的抗原表位.结果 成功克隆得到ORFV 020基因,全长549 bp,编码183个氨基酸;亚细胞定位显示该蛋白定位于细胞核和细胞质.生物信息学分析ORFV E3L蛋白α螺旋约占40.44％、β折叠约占5.46％、延伸链约占16.94％、无规则卷曲约占37.16％;该蛋白无信号肽和跨膜结构,可能存在15个磷酸化位点,7个N-糖基化位点,5个B细胞线性表位,2个CTL表位,3个Th细胞表位,3个B细胞和CTL联合表位,3个B细胞和Th细胞联合表位.结论 ORFV E3L蛋白定位于细胞核和细胞质,含有多个抗原表位,可能具有免疫原性.该蛋白高度保守,具有成为优势保护性抗原的潜力.为进一步揭示ORFV E3L蛋白的功能奠定基础,为ORFV诊断方法的建立及疫苗的研制提供了理论依据.

关键词：羊口疮病毒、基因克隆、亚细胞定位、生物信息学

所属期刊栏目：18

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家重点研发计划;甘肃省青年科技基金计划;中国农业科学院创新工程

在线出版日期：2023-04-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：141-146