细粒棘球绦虫蛋白激酶B AKT2的生物信息学及系统发育树分析

摘要：

目的 克隆细粒棘球绦虫蛋白激酶B AKT2(Echinococcus granulosus AKT2,EgAKT2)基因并分析其序列及其蛋白的生物信息. 方法 以细粒棘球蚴为对象,利用RT-PCR技术克隆获得EgAKT2基因序列并结合生物信息学方法对其蛋白质序列的跨膜区、亚细胞定位、亲水性、潜在信号肽剪切位点、ATP结合位点、磷酸化位点,及其编码蛋白的二级结构、三级结构等生物信息进行分析,并进行多序列分析和同源性比较. 结果 克隆获得EgAKT2基因序列全长为1 896 bp,编码610个氨基酸.氨基酸序列分析该基因编码蛋白为亲水性蛋白,相对分子质量为69.635 64×103,理论等电点为5.80,无信号肽序列和跨膜区;该蛋白主要定位在细胞质和细胞核,预测含有11个磷酸化位点,19个ATP结合位点,具有PKC激酶和PH结构域,二级结构以无规则卷曲为主,三级结构显示EgAKT2结构域区构成弯曲状螺旋结构.多序列比对分析,EgAKT2氨基酸序列与多房棘球绦虫的同源性为92％,进化树显示EgAKT2与人、黑猩猩的AKT2不在同一条分支. 结论 预测EgAKT2蛋白与多房棘球绦虫高度同源.该蛋白含有PKC激酶和PH结构域,可能参与调节细粒棘球绦虫能量代谢过程.

关键词：细粒棘球蚴绦虫、AKT2、生物信息学分析、系统进化

所属期刊栏目：15

分类号：R383.8(医学寄生虫学)

资助基金：国家自然科学基金No.81760369

在线出版日期：2021-04-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1411-1416,1421