口蹄疫O型Ind-2001毒株VP1蛋白T细胞、B细胞优势抗原表位的预测

摘要：

目的 获得口蹄疫病毒O/Ind2001株VP1蛋白的抗原信息. 方法 采用生物信息学方法预测VP1蛋白二级结构及其T、B淋巴细胞优势抗原表位.从GenBank中获取蛋白基因信息,通过DNAStar生物学软件、SOMPA预测蛋白质的二级结构及其理化性质;通过Phyre的同源建模服务器预测蛋白质三级结构;通过ABCpred、SYFPEITHI、IDBE等工具联合预测蛋白的T、B淋巴细胞的优势抗原表位. 结果 该蛋白由213个氨基酸组成,原子组成为C1048H1674N298O310S4,pI值为9.32,不稳定系数为21.89,亲水系数-0.327,为稳定性亲水蛋白.其二级结构主要成分为无规则卷曲,约占47.42％,预测含有多个T、B淋巴细胞抗原表位. 结论 生物信息学方法预测口蹄疫O型Ind-2001毒株VP1蛋白为稳定性蛋白,含有T、B淋巴细胞抗原表位,可为其表位疫苗的研究提供参考.

关键词：口蹄疫病毒、预测、二级结构、抗原表位、疫苗

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分类号：R37(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家重点研发计划项目-牛羊重大动物疫病基因工程疫苗及防控研究No.2017YFD0500902

在线出版日期：2020-05-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1398-1402