应用PFGE、MLST和MALDI-TOF-MS方法对克罗诺杆菌分型的研究

摘要：

目的 分别应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)、多位点序列分型(MLST)和基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对克罗诺杆菌分型并进行比较分析. 方法 不同来源的克罗诺杆菌82株分别用PFGE、MLST和MALDI-TOF MS进行分型,采用BioNumerics和SARAMIS软件进行聚类分析. 结果 82株克罗诺杆菌用PFGE法经Xba Ⅰ和Spe Ⅰ酶切后得到81个指纹图谱,相似度55.5％～100％;MLST法得到68个ST型、5个大群分别对应5个种;MALDI-TOF-MS法得到82张不同的图谱,相似度为61％～89％,分群结果同MLST法一致. 结论 MALDITOF-MS法的鉴定速度和分辨率较高,可反映出PFGE和MLST不能分辨出的细微差别,但对菌株鉴定的准确性易受图谱库容量和其他因素影响;PFGE能区分不同菌株,但不能对菌株进行种的鉴定;MLST法能准确鉴定不同种的克罗诺杆菌,但其分型分辨率低于PFGE法,且同样存在方法繁琐耗时等缺点.因此可通过完善MALDI-TOF-MS图谱数据库以提高对克罗诺杆菌鉴定的准确性,同时联合PFGE和MLST法以提高对克罗诺杆菌快速鉴定并准确分型的能力.

关键词：克罗诺杆菌、PFGE、MLST、MALDI-TOF-MS

所属期刊栏目：14

分类号：R378(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：济南市卫生和计划生育委员会科技计划2016-1-20

在线出版日期：2019-05-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：323-329