不动杆菌CRISPR系统基因结构的分析及其与耐药性关系的研究

摘要：

目的 研究不动杆菌CRISPR Cas系统的基因结构并探讨其与耐药性的关系. 方法 收集CRISPR db数据库所有不动杆菌菌株序列信息,利用CRISPRfinder软件分析CRISPR基因座;通过MEGA软件对cas基因序列进行对比及系统进化分析;收集自 GenBank中的菌株基因注释,查找相关耐药基因信息,分析其与CRISPR基因座之间的关系.结果 80株不动杆菌包含11个种,21.3％的菌株含有确定CRISPR基因座,26.5％的菌株只含可疑基因座.基因座位于染色体或质粒上.大部分不动杆菌的CRISPR系统属于I-F型,并且根据cas1、cas3、csy2、csy3、cas6/csy4基因序列及csy1基因的存在均可分为I-Fa和I-Fb两个亚型.不动杆菌CRISPR基因座中有14种不同的重复序列,长度为24～31 bp,平均重复次数为53,且不同亚型间的重复序列不同,而同一亚型内保守性较高.无CRISPR系统的菌株中A类和D类β-内酰胺酶、乙酰转移酶、核苷酸转移酶及16S rRNA甲基化酶等耐药基因的携带率均显著高于有CRISPR系统菌株. 结论 不动杆菌CRISPR系统属于I-Fa和I-Fb型,cas3、csy2、csy3、csy4、casl基因序列均可单独作为不动杆菌属CRISPR系统分亚型的依据;CRISPR基因座的存在可降低某些耐药基因的水平转移,而基因组中相对较低的CRISPR系统携带率可能是导致不动杆菌耐药率日趋增高及更易出现多重耐药的原因之一.

关键词：CRISPR-Cas系统、不动杆菌、耐药基因、基因结构

所属期刊栏目：13

分类号：R378.4(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：山东省优秀中青年科学家科研奖励基金No.BS2011SW0005

在线出版日期：2018-12-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1073-1077,1083