2017年Ⅱ型登革病毒汕头流行株的E基因序列分析

摘要：

目的 阐明2017年汕头市2型登革流行株的基因型别,为其传播途径的分子流行病学研究提供依据. 方法 采集2017年汕头市疑似登革热患者血清标本,进行登革热病毒检测,阳性者进行全长E基因PCR扩增,对扩增产物进行序列测定,采用生物信息学软件Sequencher5.1、BioEdit和Mega6.0进行序列的比对分析并构建系统进化树. 结果 有4例血清标本检出登革热病毒2型核酸,其中2例的标本扩增出E基因全长序列(1 485 bp),两者序列相似度100％,判定是由同一株病毒引起的感染.该流行株属于Cosmopolitan基因亚型,与东南亚毒株具有较高相关性.氨基酸序列分析显示该毒株E蛋白毒力位点的氨基酸为E126-E、E383～385-E-P-G、E71-A和E390-S. 结论 汕头市2017年登革病毒流行株可能为东南亚毒株并发生一定变异,其E蛋白毒力位点的氨基酸为E126-E、E383～385-E-P-G、E71-A和E390-S,属于弱毒株.

关键词：汕头市、登革病毒、E基因、序列分析

所属期刊栏目：13

分类号：R373.33(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2018-09-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：629-632,636