结核分枝杆菌PKnG蛋白结构与功能的生物信息学分析

摘要：

目的 运用生物信息学的方法分析结核分枝杆菌PKnG蛋白的结构与功能. 方法 从NCBI数据库获取PKnG的基因信息;使用protParam 工具分析PKnG基因编码蛋白的理化性质,运用ProtScale 工具分析其疏水性;运用SOPMA 工具预测其二级结构,运用SWISS-MODEL 工具模拟其三级结构;运用NCBI网站上的BLAST 工具对PKnG蛋白的保守域进行预测,运用NetPhos 3.1 Server预测其磷酸化位点;运用ABCperd服务器以及SYFPEITHI程序分别预测PKnG蛋白的B细胞和T细胞抗原表位;运用SignalP 4.1Server预测其信号肽,运用TMHMM2.0和TMpredServer对其跨膜螺旋区进行预测;运用STRING 10.5程序对其相互作用蛋白进行预测. 结果 预测PKnG基因编码蛋白由750个氨基酸构成,理论等电点5.52,为不稳定疏水蛋白,其二级结构以α-螺旋为主,有3个保守区域和多个磷酸化位点,有7个B细胞抗原表位和4个T细胞抗原表位,无信号肽和跨膜螺旋区,并发现数个相关作用蛋白. 结论 PKnG为不稳定疏水蛋白,含有T、B细胞抗原表位,具有良好的抗原性,可作为结核诊断与治疗的潜在候选因子.

关键词：结核分枝杆菌、PKnG、结构、免疫逃逸、生物信息学分析

所属期刊栏目：13

分类号：R378.91(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金;山东省自然科学基金

在线出版日期：2018-09-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：567-571