宫颈癌患者感染HPV16 E6基因突变分析
目的 分析宫颈癌患者感染HPV16癌基因E6的突变情况,为宫颈癌的防治提供科学指导.方法 选取2012-2014年2月经病理检查确诊为宫颈癌患者的宫颈癌组织作为样本,采用常规的蛋白酶K裂解、苯酚-氯仿抽提法提取HPV16的全基因组,对HPV16的全基因组和癌基因E6进行PCR扩增,对E6基因序列突变株进行测序分析,并进一步分析其进化发生学.结果 经基因序列对比发现,30份样本中有23份存在突变位点,占总样本数的76.67%,其余7份样本均未发现突变位点.在所有的突变位点中,错义突变位点有7个:176位点发生G→A的突变(1份,占3.33%);178位点发生的T→G的突变(13份,占43.33%);296位点发生T→G的突变(1份,占3.33%);350位点发生T→G的突变(6份,占20.00%);442位点发生A→C的突变(2份,占6.67%);443位点发生G→A突变(5份,16.67%);525位点发生G→A的突变(1份,占3.33%).而178位点发生的T→A突变(10.00%)和241位点T→G突变(6.67%)均为无义突变.选择HPV35型的E6基因序列作为外类群参考,引入HPV16变异体AF472508和AF472509,HPV16 E6基因的进化树分析结果显示非洲株单独构成分枝,本研究进行测序的样本中没有与三者位于同一分枝的,且样品T11和T19为Ep型变异体,而T01,03,05,07,08,10,12,14为As型变异体.结论 本研究成功找到了HPV16 E6基因的突变位点,并分析了其基因进化树,为宫颈癌的防治提供新的依据.
宫颈癌、HPV16、PCR、进化树、基因突变
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R373.9(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))
2015-06-26(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
339-342,347