龙岩市手足口病病原体柯萨奇B5病毒基因特征分析

摘要：

目的 了解龙岩市手足口病病原体柯萨奇B5病毒(Coxsackie virus B5,CVB5) VP1区基因特征及变异情况.方法 对2011年采自确诊手足口病患者的Real-time RT-PCR法检测肠道病毒通用引物阳性而肠道病毒71型(enterovirus 71,EV 71)和柯萨奇病毒A16型(Coxsackie virus A 16,CVA16)阴性未分型样品,经RD细胞分离肠道病毒.从培养上清中提取RNA核酸,经RT-PCR法初步鉴定病毒型别.应用187/222引物对扩增病毒株的VP1区,回收产物经克隆、筛选后测序.采用ClustalX、Mega5.0进行核苷酸及氨基酸序列同源性分析和进化树构建. 结果 104份未分型样品中分离到3株CVB5.3株CVB5分离株VP1区长度为330～357个核苷酸,编码110～119个氨基酸.3株间的核苷酸同源性为97％～99％,氨基酸同源性为84％～99％.比较推导的氨基酸序列,FJLY2011126h株VP1与另外2株龙岩分离株相比有18个位点差异,核苷酸序列287～288位发生插入突变,第290、291、338、339位发生颠换,与2010年长春株JN695051的同源性最高(核苷酸同源性95％～98％,氨基酸同源性84％～99％). 结论 2011年福建省龙岩市手足口病患者中存在CVB5感染,病毒与2005年法国株和国内山东、长春、昆明、浙江病毒株属同一型别.

关键词：手足口病、柯萨奇病毒B5、VP1区、种系分析

所属期刊栏目：9

分类号：R373.23(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：福建省卫生厅青年科研课题项目No.2012-1-47.

在线出版日期：2015-01-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：987-991