刚地弓形虫磷酸甘油酸酯变位酶2基因编码蛋白主要特性与抗原表位的生物信息学分析
目的 从生物信息学角度分析刚地弓形虫磷酸甘油酸酯变位酶2(TgPGAM2)基因编码蛋白的结构与抗原表位,预测该蛋白的免疫原性.方法 利用蛋白分析专家系统(ExPASy)提供的PrmParam、SOSUI、TMHMM、HNN、MotifScan,NCBI上的ORF finder、SignalP、Bcepred等生物信息学在线分析程序,结合Gene Runner、DNAMAN等生物信息学软件,分析、预测TgPGAM2蛋白的理化性质、可溶性、表面可及性、可塑性,信号肽,跨膜区,翻译后修饰位点、亲(疏)水性、二级结构、抗原表位等.结果 该蛋白由264个氨基酸组成,分子式为C1345H2097N363O385SⅡ,分子质量为29.865 3 ku,等电点理论值为6.46,波长280 nm时的吸光度(A)值为1.697,半衰期为30 h,有10个表面可及性参数≥1.9的区域、3个亲水性参数得分≥1.9的区域、3个柔韧性参数得分≥2的区域、8个翻译后修饰位点、16个潜在抗原表位,为可溶性表达蛋白.结论 刚地弓形虫PGAM2基因编码的Tg PGAM2为可溶性蛋白,具有免疫原性,可作为弓形虫病疫苗候选抗原.
刚地弓形虫、磷酸甘油酸酯变位酶2、生物信息学、抗原表位、免疫原性
05
R382.5(医学寄生虫学)
国家自然科学基金81071374
2011-03-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
840-843
