确定表达序列标签微阵列的对照参数以分析刚地弓形虫强毒株及弱毒株

摘要：

目的在应用微阵列cDNAs分析刚地弓形虫强、弱毒株差异前,实验的对照,例如,DNA的含量、阳性及阴性杂交、基线的及不同的基因表达[微阵列表达序列标签(ESTs)、cDNAs]等,均在本研究中加以确定,从而确保数据处理的计算机化及精确性.方法自弓形虫RH株及弓形虫ME49株速殖子提取RNA作为探针.PCR法扩增的ESTs及杂交对照采用MicroGrid1M机点样于载玻片上.经杂交后的玻片以ScanArray3000TM扫描并对结果进行分析.结果DNA含量可在5 ng/μl及250 ng/μl之间变化,最佳值为50 ng/μl;为分析非特异性杂交的影响必须同时设置阴性对照;对结果的计算机化处理需要几个基线的不同的基因表达作为对照. 结论当采用适当的对照、重复及完整的EST后,由此获得的更具比较性的资料将成为进一步研究的有用工具.

关键词：顶器动物亚门、速殖子、毒性、cDNA、基因表达

所属期刊栏目：14

分类号：R382.5(医学寄生虫学)

资助基金：BBSRC资助项目

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：179-181