京星黄鸡IMF系全基因组选择信号检测分析

摘要：

为研究京星黄鸡肌内脂肪(Intramuscular fat,IMF)性状的遗传基础,研究选用十六世代IMF选择系(n=252)和对照系(n=264)群体,使用XP-EHH和ΔCLR方法分析两个群体基因组选择信号分布情况,挖掘与京星黄鸡IMF性状相关的基因.结果显示:选择系IMF、甘油三酯(Triglyceride,TG)、活重、屠体重等指标均显著高于对照系;XP-EHH与ΔCLR分别注释到678和1099个基因,共同筛选到264个候选基因,这些基因与脂代谢、生长发育、神经发育等生物学过程有关,并鉴定到 ACSL3、ACSL4、GPX1、IRS4、MAPK8、PLA2G4A、PTGS2、MGLL 和 PLCB1等9个脂代谢关键候选基因.研究表明,IMF含量的表型选择引起了基因组水平变化,鉴定到9个脂肪代谢关键基因,并发现一些可能与生长和神经发育等相关的基因,为IMF遗传基础研究提供参考.

关键词：京星黄鸡、选择信号、功能分析、候选基因、肌内脂肪

所属期刊栏目：44

分类号：S831.2(家禽)

资助基金：现代农业产业技术体系建设专项;中国农业科学院动物科学研究所基础研究

在线出版日期：2023-02-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：14-20