鼻咽癌中高表达蛋白激酶及其抑制剂的生物信息学筛选

摘要：

目的：筛选鼻咽癌中高表达的激酶基因以及调控这些激酶的激酶抑制剂，为鼻咽癌的分子治疗提供新的切入点。方法利用 GEO 数据库和 SAM软件筛选鼻咽癌中高表达的激酶基因；利用 DAVID 数据库获得激酶调控的生物学功能；利用 Sell-eckchem 数据库筛选调控这些高表达激酶的激酶抑制剂，再通过文献挖掘技术筛选潜在的抗鼻咽癌新药。结果在鼻咽癌基因组中，我们共筛选出差异表达基因2360个，其中高表达激酶基因21个，分别为 CHEK1、CHEK2、PRKDC、AURKA、VRK2、STK17A、MELK、NUAK1、TRPM7、MASTL、AXL、BUB1、BUB1B、CDK4、TTK、CDC7、CASK、AKT3、TBK1和 PBK（Fold Change≥2且 P ＜0．05）。功能分析的结果显示21个高表达激酶主要参与10个功能 term 中，包括调节细胞活动相关功能，如“protein amino acid phosphoryla-tion”“phosphorylation”“phosphate metabolic process”和调控细胞周期相关功能，如“mitotic cell cycle”“cell cycle phase”“regulation of cell cycle”等。通过 Selleckchem 数据库，我们发现9个高表达激酶具有已被证实的激酶抑制剂51个。文献挖掘的结果显示在这51个激酶抑制剂中，有18个在癌症方面的研究较少，文献小于10篇，具有成为抗鼻咽癌潜力的新药物。结论鼻咽癌中共有21个激酶高表达，并可能通过调控肿瘤细胞周期等生物学功能来发挥促鼻咽癌作用；它们的抑制剂可能有潜在的抗癌作用，为鼻咽癌的分子治疗提供新的靶点。

关键词：鼻咽癌、蛋白激酶、激酶抑制剂

所属期刊栏目：25

分类号：R739.65(肿瘤学)

资助基金：内蒙古自治区自然科学基金2014MS0856；内蒙古医科大学科技百万工程项目KJbw2013014

在线出版日期：2016-11-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：720-723