贵州省2014-2017年麻疹病毒分离株血凝素基因特征
目的 分析贵州省2014-2017年麻疹病毒分离株的血凝素(Hemagglutinin,H)基因特征.方法 采集贵州省2014-2017年疑似麻疹病例的咽拭子标本,采用Vero/SLAM细胞分离麻疹病毒,提取病毒核酸,经RT-PCR方法扩增麻疹病毒H基因全序列,对序列测定、拼接,分析基因特征.结果 共获得83株H基因全序列的麻疹病毒分离株,均为H1a基因型,且有2个明显分支(Cluster A和Cluster B).分离株H基因之间核苷酸和氨基酸同源性分别为97.8%-100%和98.0%-100%;与Hla基因型参考株(China93-4)的核苷酸和氨基酸同源性分别为98.6%-98.9%和98.2%-98.7%;与中国疫苗株(S191)的核苷酸和氨基酸同源性分别为94.1%-94.5%和94.5%-95.2%.分离株均在第240氨基酸位点由丝氨酸变异为天冬酰胺(S-N),第243氨基酸位点由精氨酸变异为甘氨酸(R-G),处于Cluster A簇中的病毒株第397氨基酸位点由脯氨酸变异为亮氨酸(P-L).结论 贵州省2014-2017年麻疹病毒优势流行株为H1a基因型,且不同病毒传播链持续循环;麻疹病毒H蛋白基因的主要氨基酸位点未发生变异.
麻疹病毒、血凝素、基因型、序列分析
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R373.11(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))
贵州省卫生计生委科学技术基金项目gzwjkj2017-1-050;贵州省疾病预防控制中心科学技术基金项目2016-E2-5
2019-02-27(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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613-618,623