北京市丰台区手足口病患者肠道病毒A组71型基因特征分析
目的 研究北京市丰台区手足口病(Hand-Foot-Mouth Disease,HFMD)患者肠道病毒A组71型(Enterovirus Group A Type 71,EVA71)分离株的基因特征.方法 使用荧光定量逆转录-聚合酶链反应(Real-time Reverse Transcript-Polymerase Chain Reaction,rRT-PCR)方法对北京市丰台区2013年3～9月采集于HFMD患者的咽拭子标本进行EVA71核酸检测,对检测结果为EVA71阳性的标本,用人横纹肌肉瘤细胞进行病毒分离,对分离到的EVA71毒株进行VP1编码区基因扩增,并对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析.结果 在81份咽拭子标本中,有26份经rRT-PCR方法检测为EVA71核酸阳性,分离到6株EVA71,VP1编码区有6个散在位点(43、58、164、184、240、249)存在共变异,氨基酸组合模式为赖氨酸-丙氨酸(Alanine,Ala)-天冬氨酸-丝氨酸-苏氨酸-缬氨酸,在170位氨基酸均为Ala,在145位氨基酸均为谷氨酸.核苷酸序列分析结果表明,6株EVA71的VP1编码区核苷酸同源性为94.3％～100.0％,与C4a亚型代表株的VP1编码区核苷酸同源性最高(90.0％～ 97.6％).进化树图分析结果显示,北京市丰台区EVA71分离株与C4亚型代表株处于同一分支,并在C4a进化分支的不同簇中.结论 北京市丰台区EVA71分离株为C4亚型C4a进化分支.
肠道病毒A组71型、VP1编码区、序列分析、基因特征
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R373.11(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
中共北京市委、北京市政府重点工作及区县政府应急项目预启动编号:Z111107056811042
2016-01-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
428-431
