太原市肠道病毒A71型基因特征分析
目的 研究太原市手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease,HFMD)患者中,肠道病毒A71型(Enterovirus Type A71,EVA71)的分子进化特征.方法 采集太原市HFMD患者的咽拭子和粪便标本,采用荧光定量逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)方法检测EV核酸.然后随机选取11株EVA71阳性标本进行衣壳蛋白(Capsid Protein) VP1编码区基因扩增、核苷酸序列测定和分析,与其他48株各基因型和基因亚型的EV71代表株构建基因亲缘性关系树.结果 太原市11株EVA71均属于C4基因亚型C4a进化分支,但11株EVA71在VP1编码区核苷酸和氨基酸的同源性分别为95.7％ ～ 100.0％和99.0％ ～ 100.0％.在亲缘进化树中显示,这些EVA71处在不同的簇中,表现为11株EVA71至少属于3条病毒传播链.结论 太原市流行的EVA71属于C4基因亚型C4a进化分支,并且存在多个传播链.与中国其他地区流行的EVA71在基因亲缘关系和流行时间关系上都很接近,说明太原市EVA71不是独立进化的,而是与中国其他地区流行的EVA71在共同进化.
肠道病毒A71型、传播链、分子进化、C4基因亚型
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R373.11(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
2014-08-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
226-229
