陕西省2009～2012年肠道病毒71型VP1编码区基因特征分析

摘要：

目的 对陕西省2009～2012年肠道病毒71型(Enterovirus Type 71,EV71)的分子流行病学特征进行研究.方法 采用体外逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR),对陕西省2009 ～2012年分离自手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease,HFMD)病例的38株EV71进行衣壳蛋白(Capsid Protein) VP1编码区基因序列扩增.通过双脱氧末端终止法(Sanger法)测序,获得VP1编码区核苷酸序列.采用软件Sequencher5.0和MEGA 5.0对序列进行生物信息学分析.结果 陕西省2009 ～ 2012年流行的EV71与C4基因型C4a分支具有最高的核苷酸序列同源性,为93.4％ ～99.4％;与C4a分支代表株在亲缘性关系树上具有最近的进化关系.陕西省EV71具有较高核苷酸和氨基酸序列同源性,分别为93.3％ ～ 100％(平均97.3％)和98.3％ ～ 100％(平均99.4％).但相同年代和不同年代EV71毒株间的核苷酸序列平均差异随年代逐渐增大.结论 陕西省2009 ～ 2012年流行的EV71均属于C4基因亚型C4a分支,为中国近年来流行的优势基因亚型.陕西省EV71具有较高的基因同源性,但基因多态性随着时间逐渐增大.进一步阐明EV71在陕西省的变异变迁规律,需继续开展并加强EV71的分子流行病学监测.

关键词：肠道病毒71型、VP1编码区基因、分子流行病学

所属期刊栏目：20

分类号：R373.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2014-08-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：222-225,288