肺泡灌洗液二代测序在重症肺炎病原菌未明患者中的应用

摘要：

目的:分析宏基因组二代测序(mNGS)技术在重症肺炎病原菌未明患者中的应用价值。方法:回顾性分析扬州大学附属医院2019年6月至2020年2月采用肺泡灌洗液mNGS技术辅助诊疗的重症肺炎病原菌未明患者8例的临床资料，包括肺泡灌洗液涂片、培养、mNGS检测等结果，分析患者的临床特点与mNGS检测情况。依据mNGS结果并结合临床医师的判断，将是否明确为病原菌分为病原菌确定组、病原菌未确定组，比较两组辛普森菌群多样性指数。结果:8例患者中，男5例，女3例；年龄范围41～71岁，中位年龄62.5岁。除1例患者无慢性疾病外，其余患者合并糖尿病、慢性阻塞性肺疾病、肾脏移植等。8例患者mNGS检测阳性，3例患者常规检测阳性。病原菌确定组(
n＝5)与病原菌未确定组(
n＝3)辛普森菌群多样性指数比较，差异有统计学意义[(0.398±0.222)比(0.763±0.061)，
t＝2.709，
P＝0.035]。2例患者mNGS检测阳性与常规检测阳性结果不同。3例卡氏肺孢子虫mNGS检测阳性患者的核酸序数为120～15 580，相对丰度为24.6%～99.8%。
结论:肺泡灌洗液mNGS技术有助于医师快速、全面掌握病原菌信息，特别适用于重症肺炎病原菌未明患者。

关键词：基因组学、高通量核苷酸测序、肺炎、支气管肺泡灌洗液、血传病原体、诊断、治疗应用

所属期刊栏目：27

资助基金：江苏省药学会-奥赛康医院药学科研项目A201827;Pharmaceutical Research Project Sponsored by Aosaikang Hospital of Jiangsu Province Pharmaceutical AssociationA201827

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：2951-2955