黄芪甲苷对缺血性急性肾损伤大鼠模型长链非编码RNA表达谱的影响

摘要：

目的 研究采用长链非编码RNAs(LncRNAs)测序技术筛选黄芪甲苷(AS-IV)干预急性肾损伤(AKI)大鼠过程中肾组织相关LncRNAs的变化.方法 选取雄性SD大鼠8 只,采用随机数字表法分成两组,AKI模型组(组1):4只大鼠进行缺血再灌注(I/R)处理;AS-IV预处理组(组2):4只大鼠I/R处理前7 d分别进行AS-IV灌胃处理,I/R处理24 h后取肾组织,提取总RNA并进行质量检测,合格后进行测序实验,以差异倍数(组1/组2)≥2且P≤0.05为纳入标准,检测AKI模型组和AS-IV预处理组中的LncRNAs差异表达谱,并对差异LncRNAs进行基因本体论(GO)分析和通路(Pathway)分析,从而了解LncRNAs参与的生物学功能.结果 两组相比,差异表达的LncRNAs共232条,其中127条表达上调,105条表达下调.发现341 条mRNA表达出现差异性变化,其中178条表达上升和163条表达下降.通过GO分析获得mRNA参与的细胞生物过程、细胞组件和分子功能,LncRNAs共表达的mRNA主要参与核小体组装、染色质组装或分解、核小体组织、DNA构象变化、蛋白质-DNA复合物组装等生物过程,参与的细胞组件包括核小体、蛋白质-DNA复合物、核染色质、染色质和核核小体等成分,体现了蛋白质异源二聚反应活性、蛋白二聚化活性、DNA结合活性和核酸结合活性等分子功能.细胞通路分析LncRNAs共表达的mRNAs所参与的信号通路主要涉及到系统性红斑狼疮途径、酒精代谢途径、病毒致癌机制等,共同调控着黄芪甲苷保护AKI的生物学进程.结论 AKI模型组和AS-IV预处理组大鼠肾组织中存在差异表达的LncRNAs,生物学功能和通路分析提示这些差异表达LncRNAs可能参与黄芪甲苷改善AKI的作用机制.

关键词：黄芪甲苷、急性肾损伤、再灌注损伤、5’非翻译区、长链非编码RNA、干预性研究、疾病模型、动物、大鼠、Sprague－Dawley

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资助基金：国家自然科学基金项目81771520;浙江省医药卫生科技计划项目2019RC093;浙江省医药卫生平台计划项目2015DTA001;浙江省公益技术应用研究计划国际合作项目2016C34002 Fund program: National Natural Science Foundation Project81771520;Medical and Health Science and Technology Project of Zhejiang Province2019RC093;Medical and Health Platform Project of Zhejiang Province2015DTA001;Public Welfare Technology Application Research Program International Cooperation Project of Zhejiang Province2016C34002

在线出版日期：2019-10-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：687-692