水分子在尼古丁与α4β2烟碱乙酰胆碱受体结合过程中的作用研究

摘要：

目的 为了了解水分子在尼古丁(NCT)与α4β2烟碱乙酰胆碱受体(nAChR)结合过程中的作用机制以及其在构象稳定中的作用,对NCT与α4β2 nAChR的结合进行了分子动力学(MD)模拟.方法 对与激动剂NCT结合的α4β2 nAChR体系运行500 ns的全原子分子动力学模拟.结果 模型表明,关键的水分子存在于α4(+)β2(-)的结合部位,形成氢键连接NCT的吡啶N、β2 L121的骨架NH原子和N109的羧基氧原子.还发现与NCT结合的α4β2 nAChR中,C环开放程度在不同亚基之间有明显的差异,结论桥接水分子通过形成3个氢键连接NCT与受体蛋白,在NCT与α4β2受体的结合中起重要作用.

关键词：水分子、NCT、烟碱乙酰胆碱受体、分子动力学模拟

所属期刊栏目：42

分类号：R914(药物基础科学)

资助基金：山东省重大科技创新工程专项2018SDKJ0402-1

在线出版日期：2023-06-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：17-22