基因组信息指导下海参共附生Penicillium sclerotiorum SD-36嗜氮酮类化合物的挖掘
目的 结合生物信息学与分子遗传操作技术深入挖掘海参共附生菌核青霉Penicillium sclerotiorum SD-36的活性次级代谢产物,并探析其生物合成基因簇中转录调控因子的作用.方法 基于前期P.sclerotiorum SD-36的基因组信息,利用antiSMASH预测了 1条具有合成嗜氮酮类化合物潜力的双PKS基因簇.针对该簇中1个锌指转录因子PsAzal构建了含潮霉素抗性基因和强启动子pgpdA的转录因子基因过表达盒,转化 P.sclerotiorum SD-36原生质体后,经过抗性筛选及PCR验证获得阳性转化子OE∷PsAza1.发酵培养后高效液相色谱(HPLC)检测次级代谢产物变化并通过qRT-PCR验证基因簇核心基因的转录水平.结果 OE∷PsAza1的多种次级代谢产物产量增加,其中2个化合物通过质谱、核磁数据鉴定为活性嗜氮酮类isochromophilone Ⅵ和sclerotiorin C,其产量较野生型分别增加了约6倍和4.5倍.qRT-PCR检测该簇中2个聚酮合酶基因及Psazal基因的转录水平,显示上调60~80倍.结论 首次明确P.sclerotiorum SD-36的双PKS基因簇编码活性嗜氮酮类化合物,且转录因子PsAza1正向调控该簇核心基因的表达水平及化合物产量.研究结果为P.sclerotiorum SD-36中化合物isochromophilone Ⅵ和sclerotiorin C的生物制备及调控研究奠定理论基础.
Penicillium sclerotiorum SD-36、双 PKS 基因簇、转录因子过表达、isochromophilone Ⅵ、sclerotiorin C
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Q93(微生物学)
国家自然科学基金;山东省泰山青年学者计划;齐鲁工业大学山东省科学院生物及生物化学ESI培育学科开放课题;齐鲁工业大学山东省科学院科教产融合创新试点工程项目
2022-10-11(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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