非实时超声支气管镜联合病原宏基因组二代测序在局灶性肺部感染性疾病诊断中的应用
目的 研究非实时超声支气管镜联合病原宏基因组二代测序(Metagenomic Next-Generation Sequencing,mNGS)在局灶性肺部感染性疾病诊断中的应用.方法 前瞻性纳入住院的局灶性肺部感染性疾病患者,随机分为试验组和对照组,试验组采用非实时超声支气管镜定位收集支气管肺泡灌洗液(bronchial alveolar lavage fluid,BALF),对照组采用术前胸部CT定位采集BALF,两组BALF均进行病原宏基因学检测和传统微生物检测,包括传统培养、半乳甘露聚糖试验阳性率(真菌GM试验)和结核分枝杆菌检测及利福平耐药试验(Xpert MTB/RIF).比较两组不同检测结果的阳性率、平均住院时间和平均住院费用.结果 试验组和对照组相比,普通培养阳性率(39.58％比16.67％,P=0.013)和mNGS阳性率(89.58％比72.92％,P=0.036)均更高,差异有统计学意义.两组Xpert MTB/RIF(4.17％比2.08％,P=l)和真菌GM试验阳性率相似(6.25％比4.17％,P=0.765),差异无统计学意义.两组患者综合分析,mNGS与传统微生物检测方法相比,检出细菌真菌的阳性率比普通培养更高(61.46％比 28.13％,P＜0.001);检出结核分枝杆菌的阳性率与 Xpert MTB/RIF 相似(8.33％比 3.13％,P=0.21);检测曲霉菌阳性率与真菌GM试验相似(7.29％比5.21％,P=0.77).两组患者传统病原学检测总阳性率为36.46％,mNGS结果阳性率为81.25％,mNGS的阳性率更高,差异有统计学意义(P＜0.001).对照组mNGS结果显示35例患者为阳性,共检测出13种病原体;试验组mNGS结果显示43例患者为阳性,共检测出17种病原体.试验组的平均住院时间更短[(12.92±3.54)d比(16.35±7.49)d],平均住院费用更低[(12209.17±3956.17)元比(19044.10±17350.85)元],差异有统计学意义(P＜0.001).结论 非实时超声支气管镜定位,可提高标本阳性率.与传统微生物学检测方法相比,mNGS的病原学检出率更高.因此非实时超声支气管镜联合mNGS可提高局灶性肺部感染性疾病的诊断率,值得在临床中推广应用.
非实时超声支气管镜、宏基因组二代测序、局灶性肺部感染、支气管肺泡灌洗液
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R563;R197;R734.2
苏州市科技局科教兴卫青年项目KJXW2019027
2023-04-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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