基于TCGA分析HAVCR2基因在食管癌中表达及其与免疫微环境的关系

摘要：

目的 利用TCGA数据库中转录组数据分析HAVCR2基因在食管癌中的表达及其与临床特征、免疫微环境的关系,为改进食管癌的治疗方法提供一定的理论依据.方法 从TCGA公共数据库中获取食管癌组织及正常食管黏膜组织的RNA测序数据和食管癌组织所对应的临床数据.通过非参数检验分析HAVCR2在食管癌组织和正常食管组织的表达差异.根据TCGA-ESCA数据库中总生存期数据绘制HAVCR2高低表达组的Kaplan-Meier生存曲线,并进行Log-rank检验.通过单因素Cox回归分析初步找出影响食管癌患者生存状态的主要因素.最后评估HAVCR2表达与肿瘤免疫微环境之间的关系.结果 HAVCR2基因在食管癌组织中表达上调,但HAVCR2基因表达与食管癌患者的总生存期无关,不能够作为食管癌的预后因子.单因素Cox回归分析显示,有淋巴结转移的食管癌患者预后较差.在肿瘤微环境的分析中,HAVCR2高表达的食管癌中免疫成分和基质成分更高,但肿瘤纯度较低.HAVCR2高表达时,肿瘤微环境中免疫细胞种类及数量增多,免疫功能可能处于激活状态.高低表达组之间免疫细胞差异和免疫检查点基因表达差异显著.富集分析显示差异表达基因主要富集于与免疫相关的通路.结论 HAVCR2基因在食管癌样本中表达高于正常食管黏膜组织,与临床特征的关系并不显著,在肿瘤免疫微环境中发挥作用,表明HAVCR2基因可以为食管癌的治疗和诊断提供一定的思路.

关键词：HAVCR2、食管癌、生物信息学、免疫微环境

所属期刊栏目：24

分类号：R735.1;R573;R681.8

在线出版日期：2022-11-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：24-31