基于生物信息学的糖尿病肾病差异表达基因筛选和发病机制研究

摘要：

目的 利用生物信息学方法探讨糖尿病肾病(DN)差异基因的表达和发病机制.方法 检索获取美国国家生物技术信息中心基因表达综合数据库并获取DN外周血单个核细胞的基因表达芯片GSE142153数据集,筛选样本差异表达基因数据进行富集分析并筛选核心靶点,利用基因集富集分析方法筛选DN差异表达基因富集的生物学功能.结果 筛选获得DN差异表达基因160个,涉及肿瘤坏死因子(TNF)、NOD样受体(NLR)、核转录因子Kappa B(NF-κB)、白细胞介素17(IL17)、趋化因子(CC)等信号通路,经拓扑及基因集富集分析,白细胞介素6(IL6)、CXC趋化因子配体8(CXCL8)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、白细胞介素1B(IL1B)、细胞表面趋化因子受体2(CCR2)、趋化因子(C-X3-C-基元)受体1(CX3CR1)是DN发病过程中的核心靶点.结论 DN差异表达基因主要富集于炎性反应、脂质代谢等信号通路,涉及血管新生、细胞凋亡、缺氧、凝血等生物学过程.

关键词：糖尿病肾病;发病机制;生物信息学

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在线出版日期：2021-10-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：19-24