10.3969/j.issn.1672-9463.2021.01.002
胰腺癌中关键RNA结合蛋白的功能及预后评估价值
目的 探讨胰腺癌中差异表达RNA结合蛋白(RBPs)的功能及其相关信号通路,构建预后模型评估胰腺癌患者的预后,为胰腺癌的诊断、治疗和预后评估提供新思路.方法 利用TCGA数据库中胰腺癌患者的RNA-Seq数据,运用limma包进行差异分析,将得到的差异表达RBPs进行GO富集分析和KEGG信号通路分析并绘制PPI网络及其子网络.通过survival包筛选预后相关RBPs构建预后模型,并通过生存分析、ROC曲线绘制、风险函数评估、独立预后分析进行验证,绘制列线图有效评估预后.结果 筛选出6个上调RBPs和9个下调RBPs,构建了由ESRP1、TDRD6、RBM6、DARS2组成的预后模型并进行验证.结论 筛选差异表达的RBPs并构建预后模型,可为探讨胰腺癌的发病、诊断和药物治疗靶点提供方向.
胰腺癌、RNA结合蛋白、生物信息学、生存分析、预后模型
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湖北陈孝平科技发展基金会资助项目编号:CXPJJH118000023-02
2021-03-05(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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